public static Atomo CriarAtomo(string linhaArquivoPdb)
{
if (!string.IsNullOrWhiteSpace(linhaArquivoPdb))
{
try
{
var atomo = new Atomo();
atomo.Tipo = (linhaArquivoPdb.Substring(0, 6).Trim().Equals("ATOM") ? TipoAtomo.Atomo : TipoAtomo.Heteroatomo);
atomo.ID = Convert.ToInt32(linhaArquivoPdb.Substring(6, 5).Trim());
atomo.Nome = linhaArquivoPdb.Substring(12, 4).Trim().ToUpper();
atomo.Residuo = linhaArquivoPdb.Substring(17, 3).Trim().ToUpper();
atomo.X = Convert.ToDouble(linhaArquivoPdb.Substring(30, 8).Replace('.', ',').Trim());
atomo.Y = Convert.ToDouble(linhaArquivoPdb.Substring(38, 8).Replace('.', ',').Trim());
atomo.Z = Convert.ToDouble(linhaArquivoPdb.Substring(46, 8).Replace('.', ',').Trim());
return(atomo);
}
catch (ArgumentOutOfRangeException)
{
throw new OperationCanceledException(
"A linha do arquivo Pdb não estava em uma tabulação válida."
);
}
}
return(null);
}
public double CalcularDistanciaEuclidiana(Atomo atomo)
{
return(Math.Sqrt(
((this.X - atomo.X) * (this.X - atomo.X)) +
((this.Y - atomo.Y) * (this.Y - atomo.Y)) +
((this.Z - atomo.Z) * (this.Z - atomo.Z))
));
}
private IEnumerable <Atomo> EnumerarAtomosPorArquivo(string caminho)
{
var arquivo = File.ReadLines(caminho);
if (arquivo.Count() > 0)
{
foreach (var linha in arquivo)
{
yield return(Atomo.CriarAtomo(linha));
}
}
}
public static bool AtomoHidrofobico(Atomo atomo)
{
return(_classificacaoHidrofobica.Any(n => n.Residuo.Equals(atomo.Residuo) && n.Nome.Equals(atomo.Nome)));
}
