//Главная кнопка
private void DoWork()
{
//а я не знаю почему оно само туда не лезет
MascotProc.iLog = this;
Settings.Default.DatFileName = DatFileName.Text;
LockFDR();
//Разбор Mascot
RepProgress(0);
if (mp!=null && db == null){
Log("Parsing and grouping Mascot results:");
MascotProc.FillMSMSLists(ref Mascots, ref MSMSList, ref Proteins, mp);
}
//или переразбор текстового файла
if (tabsr!=null && db == null){
tabsr = new StreamReader(DatFileName.Text);
MascotProc.FillMSMSLists(ref Mascots, ref MSMSList, ref Proteins, tabsr);
tabsr.Close();
}
//сохранение разбора маскот в базу данных
String dbName = DBFileName.Text;
if (db == null || db.GetFileName()!=DBFileName.Text){
db = new DBInterface();
db.CreateNewDB(dbName);
SaveSettingsDB();
db.SaveProteins(Proteins);
db.SaveMSMS(Mascots,true);
if (Settings.Default.QuantiAll){
db.SaveMSMS(MSMSList,false);
}else{
MSMSList = Mascots;
}
}
//MSMSList = Mascots;
RepProgress(0);
try {
//копируем список файлов
Files = new List<string>();
for (int i = 0 ; i < RawList.Items.Count ; i++){
//если файлы еще не обработаны
if (!(RawList.Items[i].BackColor == Color.FromArgb(214,253,200))){
Files.Add(RawList.Items[i].Text);
}
}
//Создаем процессы вместе с прогресс-индикаторами
CreateProcesses(Files.Count);
if (Files.Count>0){
InitMatches();
}
NextAvialable = 0;
Processed = 0;
if (Files.Count > 0){ //запускаем обработку сырых файлов
timer1.Enabled = true;
}else{ //или сразу формируем отчет
ReportWork();
WorkCompleted(null);
}
}
catch(Exception e){
Log(e.Message,MessageBoxIcon.Error,e.StackTrace);
}
}
private void Form1_Load(object sender, EventArgs e)
{
//if (File.Exists(Settings.Default.DatFileName)){
// DatFileName.Text = Settings.Default.DatFileName;
// mp = new Mascot.MascotParser();
// mp.ParseFile(Settings.Default.DatFileName);
// OutPathName.Text = Path.GetDirectoryName(DatFileName.Text);
// folderBrowserDialog1.SelectedPath = Path.GetDirectoryName(DatFileName.Text);
//}else{
// DatFileName.Text = "";
//}
DatFileName.Text = "";
DBFileName.Text = "";
ReferenceFile = "None";
LoadReportVector();
TimeColumn.Width = 75;
MessageHeader.Width = LogList.Width-100;
RefCombo.SelectedIndex = 0;
ZeroSubstBox.SelectedIndex = 0;
LockRefFeatures(true);
RefNumber = -1;
db = null;
DBInterface.iLog = this;
RawList_ClientSizeChanged(null, null);
LogList_ClientSizeChanged(null, null);
}
private void dbOpenButton_Click(object sender, EventArgs e)
{
if(DBFileDialog.ShowDialog() != DialogResult.OK) {
return;
}
OutPathName.Text = Path.GetDirectoryName(DBFileDialog.FileName);
DBFileName.Text = DBFileDialog.FileName;
if ( db == null ) {
db = new DBInterface();
}
db.ConnectTo(DBFileName.Text);
LoadSettings();
LoadFileList();
LockForDB(true);
LoadData();
}
