public void IniciarBuscaRegiaoOri(int tamanhoAglomerado, int tamanhoKMer, int tamanhoRegiaoOri, int distHamming)
{
Clump algoritmoBusca = new Clump();
SkewDiagram skew = new SkewDiagram();
skew.genoma = arquivoFasta.genoma;
skew.tamanhoRegiaoOri = tamanhoRegiaoOri;
skew.GerarSkewDiagram();
listSkew = skew.listSkew;
ValeSkew = skew.listValesSkew[0];
algoritmoBusca.tamanhoAglomerado = tamanhoAglomerado;
algoritmoBusca.tamanhoRegiaoOri = tamanhoRegiaoOri;
algoritmoBusca.tamanhoKmer = tamanhoKMer;
algoritmoBusca.genoma = arquivoFasta.genoma;
algoritmoBusca.listPosBusca = skew.listValesSkew;
algoritmoBusca.listRegiaoOri = skew.listRegiaoOri;
algoritmoBusca.distanciaHamming = distHamming;
algoritmoBusca.inicioRegiaoOriNoGenoma = skew.inicioRegiaoOriNoGenoma;
algoritmoBusca.ProcessarGenoma();
Resultado = algoritmoBusca.dadosOri;
}
public Controller()
{
arquivoFasta = new ArquivoFasta();
listSkew = new List <int>();
Resultado = new DadosRegiaoOri();
}
