public Molecule(int _id, string _smiles, string _name)
{
ID = _id;
SMILES = _smiles;
OBConversion obconv = new OBConversion();
obconv.SetInFormat("smi");
Structure = new OBMolecule();
name = _name;
obconv.ReadString(Structure, SMILES);
Structure.SetTitle(name);
using (FileStream FS = new FileStream("temp.bin", FileMode.Create))
{
byte[] BinMol = Encoding.UTF8.GetBytes(Structure.ToMol());
FS.Write(BinMol, 0, BinMol.Length);
FS.Close();
}
obconv.SetOutFormat("_png2");
string TempPic = Functions.TempFile();
obconv.WriteFile(Structure, TempPic); // Пишем картинку в temp // Это такое колдунство // Мне стыдно, но по-другому не выходит
obconv.CloseOutFile();
Picture = Image.FromFile(TempPic);
Weight = Structure.GetMolWt();
Brutto = Structure.GetFormula();
}
private void OpenStructure(string StName)
{
// Создаём OpenBabel объекты
OBConversion obconv = new OBConversion();
OBMol mol = Functions.ReadMoleculeFromFile(StName);
obconv.SetOutFormat("_png2");
obconv.AddOption("w", OBConversion.Option_type.OUTOPTIONS, panel1.Width.ToString());
obconv.AddOption("h", OBConversion.Option_type.OUTOPTIONS, panel1.Height.ToString());
string TempPic = Functions.TempFile();
obconv.WriteFile(mol, TempPic); // Пишем картинку в temp // Это такое колдунство // Мне стыдно, но по-другому не выходит
obconv.CloseOutFile();
Bitmap bmp = new Bitmap(panel1.Width, panel1.Height);
// Рисуем на панели
panel1.BackgroundImage = bmp;
Image IM = Image.FromFile(TempPic);
Graphics g = Graphics.FromImage(panel1.BackgroundImage);
g.DrawImage(IM, 0, 0);
IM.Dispose();
g.Dispose();
panel1.Invalidate();
// Высчитываем параметры
label3.Text = "Молярная масса: " + Math.Round(mol.GetExactMass(), 4);
label4.Text = "Брутто-формула: " + mol.GetFormula();
}
private PicElement DrawMoleculeElement(Molecule Mol)
{
// Настраиваем конвертер
OBConversion obconv = new OBConversion();
obconv.SetOutFormat("_png2");
Mol.Structure.SetTitle("");
obconv.AddOption("w", OBConversion.Option_type.OUTOPTIONS, BMP_Width.ToString());
obconv.AddOption("h", OBConversion.Option_type.OUTOPTIONS, (BMP_Height - TextPanel).ToString());
// Получаем файл с картинкой
string TempPic = Functions.TempFile();
obconv.WriteFile(Mol.Structure, TempPic);
obconv.CloseOutFile();
// Рисуем структуру
Image IM = Image.FromFile(TempPic);
//Img
Bitmap bmp = new Bitmap(BMP_Width, BMP_Height);
Graphics g = Graphics.FromImage(bmp);
g.Clear(Color.White);
g.DrawImage(IM, 0, 0);
g.DrawString(Mol.name,
new Font("Arial", 14, FontStyle.Bold),
new SolidBrush(Color.Black),
new PointF(5, BMP_Height - TextPanel + 5));
g.DrawString(Mol.Status,
new Font("Arial", 12, FontStyle.Regular),
new SolidBrush(Color.Black),
new PointF(5, BMP_Height - TextPanel + 5 + new Font("Arial", 14, FontStyle.Bold).GetHeight()));
g.Dispose();
Mol.Structure.SetTitle(Mol.name);
PicElement El = new PicElement();
El.Image = bmp;
El.ID = Mol.ID;
return(El);
//Всё подчищаем
// bmp.Dispose();
// IM.Dispose();
}
public static void Get_Passport(Molecule Mol, string Filename)
{
// Настраиваем конвертер
OBConversion obconv = new OBConversion();
obconv.SetOutFormat("_png2");
Mol.Structure.SetTitle("");
obconv.AddOption("w", OBConversion.Option_type.OUTOPTIONS, "1182");
obconv.AddOption("h", OBConversion.Option_type.OUTOPTIONS, "1182");
// Получаем файл с картинкой
string TempPic = Functions.TempFile();
obconv.WriteFile(Mol.Structure, TempPic);
obconv.CloseOutFile();
Mol.Structure.SetTitle(Mol.name);
var doc = new Document(PageSize.A4);
PdfWriter.GetInstance(doc, new FileStream(Filename, FileMode.Create));
doc.Open();
BaseFont Times = BaseFont.CreateFont(Application.StartupPath + @"\Fonts\times.ttf",
BaseFont.IDENTITY_H, BaseFont.NOT_EMBEDDED);
BaseFont TimesBold = BaseFont.CreateFont(Application.StartupPath + @"\Fonts\timesb.ttf",
BaseFont.IDENTITY_H, BaseFont.NOT_EMBEDDED);
BaseFont TimesItalic = BaseFont.CreateFont(Application.StartupPath + @"\Fonts\timesi.ttf",
BaseFont.IDENTITY_H, BaseFont.NOT_EMBEDDED);
BaseFont TimesBoldItalic = BaseFont.CreateFont(Application.StartupPath + @"\Fonts\timesbi.ttf",
BaseFont.IDENTITY_H, BaseFont.NOT_EMBEDDED);
Font Regular = new Font(Times, 14);
Font Bold = new Font(TimesBold, 14);
Font LargeBold = new Font(TimesBold, 18);
Font SubScribe = new Font(Times, 10);
doc.Add(AddText("Институт органического синтеза им. И.Я. Постовского УрО РАН", Bold,
Element.ALIGN_CENTER));
doc.Add(AddText(" ", Bold));
doc.Add(AddText("620041, г. Екатеринбург, ул. С. Ковалевской/Академическая, 20/22,\n" +
"Телефоны (343) 374-11-89, (343) 369-30-58", Regular, Element.ALIGN_CENTER));
doc.Add(AddLine());
doc.Add(AddText("ПАСПОРТ НА ОБРАЗЕЦ № " + Mol.name, LargeBold, Element.ALIGN_CENTER));
doc.Add(AddImage(TempPic, 250));
doc.Add(AddText("Молярная масса: ",
new[] { new Phrase(Math.Round(Mol.Structure.GetMolWt(), 2).ToString(), Regular) }, Bold));
doc.Add(AddText("Брутто формула: ",
new[] { SetSuperSubScript(Mol.Structure.GetFormula(), Regular, SubScribe, SUBSCRIPT) }, Bold));
doc.Add(AddText("Физическое состояние: ",
new[] { new Phrase(Mol.State, Regular) }, Bold));
doc.Add(AddText("Температура плавления: ",
new[] { new Phrase(Mol.MeltingPoint, Regular) }, Bold));
doc.Add(AddText("Охарактеризовано: ",
new[] { SetSuperSubScript(Mol.GetAnalys_Whom(), Regular, SubScribe, SUPERSCRIPT) }, Bold));
doc.Add(AddText("Растворимость: ",
new[] { new Phrase(Mol.Solution, Regular) }, Bold));
doc.Add(AddText("Условия хранения: ",
new[] { new Phrase(Mol.Conditions, Regular) }, Bold));
doc.Add(AddText("Масса образца: ",
new[] { new Phrase(Mol.Mass + " мг", Regular) }, Bold));
doc.Add(AddText("Синтезировал: ",
new[] { new Phrase(Mol.MadeBy.Job + ", " + Mol.MadeBy.GetInitNameFirst() +
" (" + Mol.LaboratoryName + ")", Regular) }, Bold));
doc.Add(AddText("НАУЧНЫЙ РУКОВОДИТЕЛЬ", Bold));
PdfPTable table = new PdfPTable(2);
table.WidthPercentage = 100;
table.AddCell(new PdfPCell(new Phrase("академик", Bold))
{
HorizontalAlignment = Element.ALIGN_LEFT,
BorderWidth = 0
});
table.AddCell(new PdfPCell(new Phrase("В.Н. Чарушин", Bold))
{
HorizontalAlignment = Element.ALIGN_RIGHT,
BorderWidth = 0
});
doc.Add(table);
doc.Close();
}