private bool SetMiseqFlow()
{
viewParameters = GetFlowProperties();
if (viewParameters == null)
{
return(false);
}
this.flow = new MiseqFlow(viewParameters, mainLog);
return(true);
}
private bool SetMinionFlow()
{
if (!isFast5Analysis())
{
return(false);
}
// 2020.01.20 混合は認めない。
if (InputFolderFileCheck(SelectDataList))
{
return(false);
}
var analysisProperties = string.Empty;
IEnumerable <Barcode2Name> barcodeList = null;
if (SelectDataList.Where(s => Directory.Exists(s) || s.EndsWith(".fast5")).Any())
{
bool isBarcodeComit = false;
using (var barcodeView = new BarcodeManagementViewModel(this.SelectDataList, this.IsOneSample, this.IsBarcode))
{
Messenger.Raise(new TransitionMessage(barcodeView, "BarcodeManagementCommand"));
barcodeList = barcodeView.BarcodeList; // user input sample-names
analysisProperties = barcodeView.SelectedConfig;
isBarcodeComit = barcodeView.IsCommand;
};
// barcode view で、ボタン押下以外でCloseした。
if (!isBarcodeComit)
{
return(false);
}
}
viewParameters = GetFlowProperties(barcodeList, analysisProperties);
if (viewParameters == null)
{
return(false);
}
this.flow = new MinionFlow(viewParameters, mainLog);
return(true);
}
private void Anarysis()
{
if (!IsAnalysisOK())
{
return; // 必要なものがない。
}
// defalt parameter name save.
if (_isMinion)
{
Properties.Settings.Default.minion_param = _selectedParameter;
}
if (_isMiseq)
{
Properties.Settings.Default.miseq_param = _selectedParameter;
}
Properties.Settings.Default.Save();
var analysisProperties = string.Empty;
AnalysisViewParameters viewParameters = null;
// minion ?
if (_isMinion)
{
if (!isFast5Analysis())
{
return;
}
// 2020.01.20 混合は認めない。
if (InputFolderFileCheck(SelectDataList))
{
return;
}
// var sampleList = new ObservableCollection<Barcode2Name>();
IEnumerable <Barcode2Name> barcodeList = null;
if (_selectDataList.Where(s => Directory.Exists(s) || s.EndsWith(".fast5")).Any())
{
bool isBarcodeComit = false;
using (var barcodeView = new BarcodeManagementViewModel(this._selectDataList, this._isOneSample, this._isBarcode))
{
Messenger.Raise(new TransitionMessage(barcodeView, "BarcodeManagementCommand"));
barcodeList = barcodeView.BarcodeList; // user input sample-names
analysisProperties = barcodeView.SelectedConfig;
isBarcodeComit = barcodeView.IsCommand;
};
// barcode view で、ボタン押下以外でCloseした。
if (!isBarcodeComit)
{
return;
}
}
viewParameters = GetFlowProperties(barcodeList, analysisProperties);
if (viewParameters != null)
{
flow = new MinionFlow(viewParameters, mainLog);
}
}
if (_isMiseq)
{ // Miseq flow
viewParameters = GetFlowProperties();
if (viewParameters != null)
{
flow = new MiseqFlow(viewParameters, mainLog);
}
}
// Select folder cancel.
if (viewParameters == null)
{
return;
}
// flow properties が 正常 = ユーザが save Dir を指定した。
if (flow != null)
{
AnalysisButton = buttonCancel;
// タスクマネージャ起動
System.Diagnostics.Process.Start(
new System.Diagnostics.ProcessStartInfo("taskmgr")
{
UseShellExecute = true
});
_ = ProcessAsync(flow);
}
}
