public HrvResults ProcessData(HrvRawData rawHrvData)
{
base.ProcessData(rawHrvData);
double[] valid_intervals_durations = null;
List <CardioInterval> valid_intervals = null;
// recorded data contains cardio intervals
// this is the case when the inspection was performed
// using a cardio intervals sensor
// (e.g. Bluetooth HR sensor with RR intervals)
if (InputDataContainsCardioIntervals(rawHrvData))
{
var heartRythmData = ReadCardioIntervalsFromResultSet(rawHrvData);
valid_intervals = heartRythmData.Item1;
HrvResults.RATED_HR_MARKS = heartRythmData.Item2.ToArray();
}
else
{
ChannelData data = null, adc_data = null;
double[] hrv_marks = null;
SelectAndProcessSignal(m_settings.RejectLowQualitySignalAreas, rawHrvData, out hrv_marks, out data, out adc_data);
if ((null == data) || (null == adc_data))
{
throw new DataProcessingException(strings.NoSignalInSourceData);
}
HrvResults.CRV_CARDIO_SIGNAL = new PhysioSignalView(
data.GetDataAsFloat(),
(int)data.BitsPerSample,
(float)data.SamplingRate,
data.PhysioSignalType
);
HrvResults.CRV_CARDIO_SIGNAL_ADC = new PhysioSignalView(
adc_data.GetDataAsFloat(),
(int)adc_data.BitsPerSample,
(float)adc_data.SamplingRate,
adc_data.PhysioSignalType
);
// отметки пульса с оценкой достоверности
var hc_marks_to_rate = new List <RatedContractionMark>(hrv_marks.Length);
for (int i = 0; i < hrv_marks.Length; ++i)
{
var mark = new RatedContractionMark
{
Position = hrv_marks[i],
Valid = false
};
hc_marks_to_rate.Add(mark);
}
// получаем достоверные интервалы в миллисекундах,
// "хорошие" сокращения будут помечены как хорошие (по обоим параметрам),
var converted_peaks =
PeaksFilter.ConvertPeaksToIntervalsWithRejectionAndRatePeaks(
hc_marks_to_rate,
data.SamplingRate,
m_settings.GetApplicableMinIntervalLength(),
m_settings.GetApplicableMaxIntervalLength(),
m_settings.GetApplicableMaxIntervalDeltaRelative(),
adc_data);
valid_intervals = converted_peaks.extracted_intervals;
if (converted_peaks.extracted_intervals.Count < 5)
{
throw new DataProcessingException(string.Format(strings.too_few_intervals_detected_in_signal, valid_intervals.Count));
}
// это все отметки пульса
HrvResults.CRV_HR_MARKS = hrv_marks;
// это отметки пульса с оценками качества
HrvResults.RATED_HR_MARKS = converted_peaks.rated_heart_contraction_marks.ToArray();
// Спектр сигнала ФПГ
HrvResults.SignalSpectrum = PpgSpectrumAnalyzer.CalculateSpectrum(data.Data, data.SamplingRate);
}
// только длительности интервалов
valid_intervals_durations = (from interval in valid_intervals select interval.duration).ToArray();
var peakAmoDistrib = default(MinMaxModeDescriptor);
// кардио-интервалы подготовлены
try
{
var mathStatData = new StatData();
// считаем статистику по кардио-интервалам
Calculator.CalcStatistics(valid_intervals_durations, mathStatData);
Calculator.MakeProbabilityDensity(valid_intervals_durations, mathStatData, 440, 2000, 4);
// The standard approach
Calculator.MakeDistribution(valid_intervals_durations, mathStatData, 0, 2500, 50);
// Find the maximized & minimized mode amplitude values
peakAmoDistrib = MinMaxModeAmpFinder.GetPeakAmoDistrib(valid_intervals_durations, 50, 0, 2500, 1);
HrvResults.CRV_STAT = _mapper.Map <Methods.ObjectModel.Statistics.StatData>(mathStatData);
}
catch (ArgumentException)
{
throw new DataProcessingException(
string.Format(strings.too_few_valid_intervals_detected_in_signal, valid_intervals_durations.Length));
}
HrvResults.Indicators.HRV_Triangular_Index = CalcHrvTriangularIndex(valid_intervals_durations);
double AMo = Statistics.distribution.mode_amplitude; // Безразмерная -- в долях от 1
double Mo = Statistics.distribution.mode / 1000; // В секундах!!!
//double AMo = peakAmoDistrib.ModeAmp; // Безразмерная -- в долях от 1
//double Mo = peakAmoDistrib.Mode / 1000; // В секундах!!!
double M = Statistics.m / 1000; // В секундах!!!
double dNN = Statistics.varRange / 1000; // В секундах!!!
double Sigma = Statistics.sigma / 1000; // В секундах!!!
var _AMo = Statistics.distribution.mode_amplitude; // Безразмерная -- в долях от 1
var _Mo = Statistics.distribution.mode / 1000; // В секундах!!!
var AmoMax = peakAmoDistrib.MaxModeDescriptor.ModeAmp; // maximized Mode Amplitude
var MoMax = peakAmoDistrib.MaxModeDescriptor.Mode / 1000; // Mode when the Mode amplitude is maximized
var AmoMin = peakAmoDistrib.MinModeDescriptor.ModeAmp; // minimized Mode Amplitude
var MoMin = peakAmoDistrib.MinModeDescriptor.Mode / 1000; // Mode when the Mode amplitude is minimized
var AmoMid = peakAmoDistrib.MidModeDescriptor.ModeAmp; // mean Mode Amplitude
var MoMid = peakAmoDistrib.MidModeDescriptor.Mode / 1000; // Mode when the Mode amplitude is close to mean
// Вычислим индексы Баевского
// умножаем на 100, т.к. "по Баевскому" АМо указывается в %%.
HrvResults.Indicators.IN = AMo * 100 / (2.0 * Mo * dNN);
HrvResults.Indicators.IN_Max = AmoMax * 100 / (2.0 * MoMax * dNN);
HrvResults.Indicators.IN_MaxMode = MoMax;
HrvResults.Indicators.IN_Min = AmoMin * 100 / (2.0 * MoMin * dNN);
HrvResults.Indicators.IN_MinMode = MoMin;
HrvResults.Indicators.IN_Mid = AmoMid * 100 / (2.0 * MoMid * dNN);
HrvResults.Indicators.IN_MidMode = MoMid;
// TODO: выяснить, что правильно, что нет: m_BaevskyStatistics._VPR = 1.f / (fM * fX);
HrvResults.Indicators.VPR = 1.0 / (Mo * dNN);
HrvResults.Indicators.PAPR = AMo * 100 / Mo;
HrvResults.Indicators.IVR = AMo * 100 / dNN;
// Психофизиологическая цена [адаптации]
// АМ [%%] / ( Мат. ожидание [с] * сигма [с] )
// умножаем на 100, т.к. АМо д.б. в %%.
HrvResults.Indicators.PPPA = AMo * 100 / (M * Sigma);
// Передать в результаты теста также и сами кардиоинтервалы
// с моментами их появления в записи
HrvResults.CRV_INTERVALS = valid_intervals.ToArray();
// Спектр кардиоинтервалов
HrvResults.IntervalsSpectrum = HrvSpectrumAnalyzer.MakeCardioIntervalsSpectrum(valid_intervals);
double sum = 0.0;
double n50 = (valid_intervals[0].duration > 50) ? 1 : 0;
for (int i = 1; i < valid_intervals.Count; i++)
{
double diff = valid_intervals[i].duration - valid_intervals[i - 1].duration;
sum += Math.Pow(diff, 2);
if (diff > 50)
{
n50++;
}
}
HrvResults.Indicators.pNN50 = 100.0 * n50 / (valid_intervals.Count - 1);
HrvResults.Indicators.RMSSD = Math.Sqrt(sum);
HrvResults.CRV_SCATTEROGRAMM_PARAMETERS = GetScatterParams(valid_intervals_durations);
HrvResults.ResultsReliability = GetResultsReliability(HrvResults);
return((HrvResults)ProcessorOutputData);
}
private static double Estimate_AverageInterval(
List <RatedContractionMark> hr_marks_to_rate,
double data_rate,
double min_interval_length,
double max_interval_length,
double max_relative_delta
)
{
double[] coordinates = new double[hr_marks_to_rate.Count];
for (int i = 0; i < coordinates.Length; ++i)
{
coordinates[i] = hr_marks_to_rate[i].Position;
}
// это черновой список интервалов, учитывающий всю последовательность
// интервалов, получающихся из всей последовательности сокращений за исключением
// интервалов, не удовлетворяющих ограничениям min_interval_length, max_interval_length
// и max_relative_delta.
// при проверке первого интервала на относительное изменение величина предыдущего интервала
// принимается равной значению моды черновой последовательности кардио-интервалов.
var draft_intervals = PeaksFilter.CoordinatesToIntervals(coordinates, data_rate);
var draft_durations = new List <double>(draft_intervals.Count);
foreach (CardioInterval draft_interval_1 in draft_intervals)
{
draft_durations.Add(draft_interval_1.duration);
}
double[] draft_durations_array = draft_durations.ToArray();
var stat = new PskOnline.Math.Statistics.StatData();
PskOnline.Math.Statistics.Calculator.CalcStatistics(draft_durations_array, stat);
PskOnline.Math.Statistics.Calculator.MakeProbabilityDensity(draft_durations_array, stat, 400, 2000, 4);
double ave = 0;
double prev_interval_duration = stat.probability_density.mode;
int draft_count = 0;
bool bLengthOk = false;
bool bRDeltaOk = false;
foreach (CardioInterval draft_interval in draft_intervals)
{
bLengthOk = (draft_interval.duration >= min_interval_length) &&
(draft_interval.duration <= max_interval_length);
bRDeltaOk = (max_relative_delta >= (System.Math.Abs(prev_interval_duration - draft_interval.duration) / prev_interval_duration));
if (bLengthOk && bRDeltaOk)
{
// учтем "хороший" интервал
ave += draft_interval.duration;
++draft_count;
prev_interval_duration = draft_interval.duration;
}
}
if (draft_count == 0)
{
throw new DataProcessingException(
string.Format(strings.too_few_valid_intervals_detected_in_signal, draft_count));
}
return(ave / ((double)draft_count));
}
