public void InsertSample(SampleDataAttributes da)
{
using (SqlConnection con = new SqlConnection(connectionString))
{
try
{
con.Open();
SqlCommand cmd = new SqlCommand();
switch (da.SampleType)
{
case "ATAC-Seq":
cmd = new SqlCommand("spAddSample_ATAC_Seq", con);
cmd.Parameters.Add(new SqlParameter("@Transposase_Unit", da.ATACTransposaseUnit));
cmd.Parameters.Add(new SqlParameter("@PCR_Cycles", da.ATACPCRCycles));
break;
case "ChIP-Seq":
cmd = new SqlCommand("spAddSample_ChIP_Seq", con);
cmd.Parameters.Add(new SqlParameter("@Antibody", da.ChIPAntibody));
cmd.Parameters.Add(new SqlParameter("@Antibody_Lot", da.ChIPAntibodyLot));
cmd.Parameters.Add(new SqlParameter("@Antibody_Catalogue_Number", da.ChIPAntibodyCatalogueNumber));
break;
case "Hi-C":
cmd = new SqlCommand("spAddSample_Hi_C", con);
cmd.Parameters.Add(new SqlParameter("@Restriction_Enzyme", da.HIRestrictionEnzyme));
cmd.Parameters.Add(new SqlParameter("@PCR_Cycles", da.HIPCRCycles));
break;
case "RNA-Seq":
cmd = new SqlCommand("spAddSample_RNA_Seq", con);
cmd.Parameters.Add(new SqlParameter("@Prep_Type", da.RNAPrepType));
cmd.Parameters.Add(new SqlParameter("@RIN", da.RNARIN));
break;
}
cmd.CommandType = CommandType.StoredProcedure;
cmd.Parameters.Add(new SqlParameter("@Sample_Type", da.SampleType));
cmd.Parameters.Add(new SqlParameter("@Genome_Type", da.GenomeType));
cmd.Parameters.Add(new SqlParameter("@Cell_Type", da.CellType));
cmd.Parameters.Add(new SqlParameter("@Treatment", da.Treatment));
cmd.Parameters.Add(new SqlParameter("@Condition", da.Condition));
cmd.Parameters.Add(new SqlParameter("@Comments", da.Comments));
cmd.Parameters.Add(new SqlParameter("@Concentration", da.Concentration));
cmd.Parameters.Add(new SqlParameter("@Volume", da.Volume));
cmd.Parameters.Add(new SqlParameter("@Initials", da.Initials));
cmd.Parameters.Add(new SqlParameter("@PI_Value", da.PIValue));
cmd.Parameters.Add(new SqlParameter("@Date_Of_Addition", da.DateOfAddition));
cmd.ExecuteNonQuery();
con.Close();//needed?
}
catch (SqlException e)
{
MessageBox.Show(e.Message.ToString());
}
}
}
public void EnterData(SampleDataAttributes sampleDataAttributes)
{
databaseWriter.InsertSample(sampleDataAttributes);
}
