getListOfParameters() public method

public getListOfParameters ( ) : ListOfParameters
return ListOfParameters
コード例 #1
0
ファイル: SbmlFunctions.cs プロジェクト: ecell/ecell3-ide
        /// <summary>
        /// [ ParameterStruct ]
        /// [[ Id , Name , Value , Unit , Constant ]]
        /// </summary>
        /// <param name="aSBMLmodel"></param>
        /// <returns></returns>
        public static List<ParameterStruct> getParameter(Model aSBMLmodel)
        {
            List<ParameterStruct> list = new List<ParameterStruct>();

            ListOfParameters parameters = aSBMLmodel.getListOfParameters();
            for (int i = 0; i < parameters.size(); i++ )
            {
                Parameter aParameter = aSBMLmodel.getParameter(i);

                string anId_Pa = aParameter.getId();
                string aName_Pa = aParameter.getName();
                double aValue_Pa = GetParameterValue(aParameter);

                string anUnit_Pa = aParameter.getUnits();
                bool aConstant_Pa = aParameter.getConstant();

                ParameterStruct parameter = new ParameterStruct(
                    anId_Pa,
                    aName_Pa,
                    aValue_Pa,
                    anUnit_Pa,
                    aConstant_Pa);

                list.Add(parameter);
            }
            return list;
        }
コード例 #2
0
 public void test_Parameter_parent_create()
 {
     Model m = new Model(2,4);
       Parameter p = m.createParameter();
       ListOf lo = m.getListOfParameters();
       assertTrue( lo == m.getParameter(0).getParentSBMLObject() );
       assertTrue( lo == p.getParentSBMLObject() );
       assertTrue( m == lo.getParentSBMLObject() );
 }
コード例 #3
0
 public void test_Parameter_parent_add()
 {
     Parameter ia = new Parameter(2,4);
       Model m = new Model(2,4);
       ia.setId("p");
       m.addParameter(ia);
       ia = null;
       ListOf lo = m.getListOfParameters();
       assertTrue( lo == m.getParameter(0).getParentSBMLObject() );
       assertTrue( m == lo.getParentSBMLObject() );
 }
コード例 #4
0
ファイル: TestAncestor.cs プロジェクト: mgaldzic/copasi_api
 public void test_Parameter_ancestor_create()
 {
     Model m = new Model(2,4);
       Parameter p = m.createParameter();
       ListOf lo = m.getListOfParameters();
       assertTrue( p.getAncestorOfType(libsbml.SBML_MODEL) == m );
       assertTrue( p.getAncestorOfType(libsbml.SBML_LIST_OF) == lo );
       assertTrue( p.getAncestorOfType(libsbml.SBML_DOCUMENT) == null );
       assertTrue( p.getAncestorOfType(libsbml.SBML_EVENT) == null );
       Parameter obj = m.getParameter(0);
       assertTrue( obj.getAncestorOfType(libsbml.SBML_MODEL) == m );
       assertTrue( obj.getAncestorOfType(libsbml.SBML_LIST_OF) == lo );
       assertTrue( obj.getAncestorOfType(libsbml.SBML_DOCUMENT) == null );
       assertTrue( obj.getAncestorOfType(libsbml.SBML_EVENT) == null );
 }
コード例 #5
0
ファイル: TestAncestor.cs プロジェクト: mgaldzic/copasi_api
 public void test_Parameter_ancestor_add()
 {
     Parameter ia = new Parameter(2,4);
       Model m = new Model(2,4);
       ia.setId("p");
       m.addParameter(ia);
       ia = null;
       ListOf lo = m.getListOfParameters();
       Parameter obj = m.getParameter(0);
       assertTrue( obj.getAncestorOfType(libsbml.SBML_MODEL) == m );
       assertTrue( obj.getAncestorOfType(libsbml.SBML_LIST_OF) == lo );
       assertTrue( obj.getAncestorOfType(libsbml.SBML_DOCUMENT) == null );
       assertTrue( obj.getAncestorOfType(libsbml.SBML_EVENT) == null );
 }
コード例 #6
0
ファイル: TestReadSBML.cs プロジェクト: mgaldzic/copasi_api
 public void test_ReadSBML_metaid_ListOf()
 {
     SBase sb;
       string s = wrapSBML_L2v1("<listOfFunctionDefinitions metaid='lofd'/>" +
     "<listOfUnitDefinitions     metaid='loud'/>" +
     "<listOfCompartments        metaid='loc'/>" +
     "<listOfSpecies             metaid='los'/>" +
     "<listOfParameters          metaid='lop'/>" +
     "<listOfRules               metaid='lor'/>" +
     "<listOfReactions           metaid='lorx'/>" +
     "<listOfEvents              metaid='loe'/>");
       D = libsbml.readSBMLFromString(s);
       M = D.getModel();
       assertTrue( M != null );
       sb = M.getListOfFunctionDefinitions();
       assertEquals( true, sb.isSetMetaId() );
       assertTrue((  "lofd" == sb.getMetaId() ));
       sb = M.getListOfUnitDefinitions();
       assertEquals( true, sb.isSetMetaId() );
       assertTrue((  "loud" == sb.getMetaId() ));
       sb = M.getListOfCompartments();
       assertEquals( true, sb.isSetMetaId() );
       assertTrue((  "loc" == sb.getMetaId() ));
       sb = M.getListOfSpecies();
       assertEquals( true, sb.isSetMetaId() );
       assertTrue((  "los" == sb.getMetaId() ));
       sb = M.getListOfParameters();
       assertEquals( true, sb.isSetMetaId() );
       assertTrue((  "lop" == sb.getMetaId() ));
       sb = M.getListOfRules();
       assertEquals( true, sb.isSetMetaId() );
       assertTrue((  "lor" == sb.getMetaId() ));
       sb = M.getListOfReactions();
       assertEquals( true, sb.isSetMetaId() );
       assertTrue((  "lorx" == sb.getMetaId() ));
       sb = M.getListOfEvents();
       assertEquals( true, sb.isSetMetaId() );
       assertTrue((  "loe" == sb.getMetaId() ));
 }