C# (CSharp) PoaConsensusの例

コード例 #1

        public void Simple()
        {
            var reads = new StringVector();

            reads.Add("TTTACAGGATAGTCCAGT");
            reads.Add("ACAGGATACCCCGTCCAGT");
            reads.Add("ACAGGATAGTCCAGT");
            reads.Add("TTTACAGGATAGTCCAGTCCCC");
            reads.Add("TTTACAGGATTAGTCCAGT");
            reads.Add("TTTACAGGATTAGGTCCCAGT");
            reads.Add("TTTACAGGATAGTCCAGT");
            string r = PoaConsensus.FindConsensus(reads).Sequence();

            Assert.AreEqual("TTTACAGGATAGTCCAGT", r);
        }

コード例 #2

ファイル: Demo.cs プロジェクト: oppaus/ConsensusCore

        public static void Test2()
        {
            var reads = new StringVector();

            reads.Add("TTTACAGGATAGTCCAGT");
            reads.Add("ACAGGATACCCCGTCCAGT");
            reads.Add("ACAGGATAGTCCAGT");
            reads.Add("TTTACAGGATAGTCCAGTCCCC");
            reads.Add("TTTACAGGATTAGTCCAGT");
            reads.Add("TTTACAGGATTAGGTCCCAGT");
            reads.Add("TTTACAGGATAGTCCAGT");
            string r = PoaConsensus.FindConsensus(reads).Sequence();

            Console.WriteLine(r);
        }