/// <summary>
/// Возвращает время от получения первого отсчета в данном канале
/// до создания данного маркера
/// </summary>
/// <param name="markerId"></param>
/// <param name="channel"></param>
/// <returns></returns>
public static TimeSpan GetChannelTimeForMarker(
this PatientPhysioData _this, long markerId, ChannelData channel)
{
Marker marker = _this.GetMarkerByIdOrDefault(markerId);
System.Diagnostics.Debug.Assert(marker != null);
ChannelMark cm = GetChannelMarkByChannelName(marker.ChannelMarks, channel.ChannelId);
// Длина канала в микросекундах
double channelDataMicroseconds = ((double)channel.Data.Length) / channel.BitsPerSample * OneM;
// Положение метки относительно начала данных канала в микросекундах
double channelMarkerMicroseconds = ((double)cm.Count) / channel.BitsPerSample * OneM + (double)cm.Offset;
if (channelMarkerMicroseconds < 0)
{
System.Diagnostics.Debug.Assert(false);
// такая ситуация может возникнуть в двух случаях
// 1. когда метка поставлена в начале отсчета временной шкалы измерения,
// а за время выполнения цикла создания меток каналов в одном из каналов
// появились новые данные, при этом смещение метки канала будет отрицательным,
// а абсолютное значение смещения может быть больше чем (cm.Count / channel.BitsPerSample * 1000000.0)
// 2. когда метка ставится на канал, в котором еще нет данных
channelMarkerMicroseconds = 0;
}
// исправить
//return new System.TimeSpan( (marker.TimestampUsec - cm.Offset) * 10 );
// на
return(new TimeSpan((long)Math.Floor(Math.Min(channelMarkerMicroseconds, channelDataMicroseconds)) * 10));
}
/// <summary>
/// защита от неправильного использования отсутствует,
/// поэтому нельзя делать эту функцию public
/// </summary>
public static ChannelData CutChannelDataFromLeftToRight(
this PatientPhysioData _this, ChannelData channel_data, Marker left_marker, Marker right_marker)
{
System.Diagnostics.Debug.Assert(channel_data != null);
lock (channel_data)
{
int left_index = 0;
int right_index = channel_data.Data.Length - 1;
if (left_marker != null)
{
ChannelMark lcm = GetChannelMarkByChannelName(left_marker.ChannelMarks, channel_data.ChannelId);
System.Diagnostics.Debug.Assert(lcm != null);
double offsetInSeconds = ((double)lcm.Offset) / OneM;
long offsetInSamples = (long)Math.Floor(offsetInSeconds * channel_data.SamplingRate);
left_index = (int)Math.Max(lcm.Count + offsetInSamples - 1, left_index);
}
if (right_marker != null)
{
ChannelMark rcm = GetChannelMarkByChannelName(right_marker.ChannelMarks, channel_data.ChannelId);
System.Diagnostics.Debug.Assert(rcm != null);
double offsetInSeconds = ((double)rcm.Offset) / OneM;
long offsetInSamples = (long)Math.Floor(offsetInSeconds * channel_data.SamplingRate);
right_index = (int)Math.Min(rcm.Count + offsetInSamples - 1, right_index);
}
return(new ChannelData(channel_data, left_index, right_index));
}
}
/// <summary>
/// Смещает метку канала на заданное кол-во микросекунд.
/// Возвращает смещение в микросекундах,
/// на которое реально была перемещена метка канала.
/// </summary>
/// <param name="markerId">Идентификатор метки</param>
/// <param name="markerOffset">Смещение метки в микросекундах</param>
/// <param name="channelName">Имя канала данных</param>
public static double MoveChannelMarker(
this PatientPhysioData _this,
long markerId,
long markerOffset,
string channelName)
{
if (!_this.ContainsMarker(markerId))
{
return(0);
}
var marker = _this.GetMarkerByIdOrDefault(markerId);
var channelMarker = GetChannelMarkByChannelName(marker.ChannelMarks, channelName);
if (null == channelMarker)
{
return(0);
}
var channel = _this.GetChannelData(channelName);
if (null == channel)
{
return(0);
}
return(_this.MoveChannelMarker(channelMarker, markerOffset, channel));
}
public static ChannelData GetChannelDataFromLeftToRight(
this PatientPhysioData _this,
ChannelData channelData,
long leftMarkerId,
long rightMarkerId)
{
return(_this.GetChannelDataFromLeftToRight(channelData, leftMarkerId, 0, rightMarkerId, 0));
}
public static PatientPhysioData GetFromLeftToRight(this PatientPhysioData _this, long leftMarkerId, long rightMarkerId)
{
Marker leftMarker = _this.GetMarkerByIdOrDefault(leftMarkerId);
Marker rightMarker = _this.GetMarkerByIdOrDefault(rightMarkerId);
// Вырезать данные и вернуть их.
return(_this.CutPhysioDataFromLeftToRight(leftMarker, rightMarker));
}
public static ChannelData GetChannelDataFromLeftToRight(
this PatientPhysioData _this,
string channelName,
long leftMarkerId,
long rightMarkerId)
{
var channelData = _this.GetChannelData(channelName);
return(_this.GetChannelDataFromLeftToRight(channelData, leftMarkerId, 0, rightMarkerId, 0));
}
/// <summary>
/// Возвращает сигналы по типу физиологических данных.
/// </summary>
/// <param name="physioSignalType">Тип требуемого физиологического сигнала.</param>
/// <returns></returns>
/// <remarks></remarks>
public static IEnumerable <ChannelData> GetChannelDataBySignalType(this PatientPhysioData _this, SignalType physioSignalType)
{
if (physioSignalType == SignalType.Any)
{
return(_this.Channels.Values);
}
return(_this.Channels.Values
.Where(c => c.PhysioSignalType == physioSignalType)
.Select(c => new ChannelData(c)));
}
public static long GetChannelDataCountForMarker(
this PatientPhysioData _this, ChannelData data, long markerId)
{
Marker marker = _this.GetMarkerByIdOrDefault(markerId);
if (null != marker)
{
ChannelMark m = GetChannelMarkByChannelName(marker.ChannelMarks, data.ChannelId);
if (null != m)
{
return(m.Count + ((long)(((double)m.Offset) * data.SamplingRate / OneM)));
}
}
return(-1);
}
/// <summary>
/// защита от неправильного использования отсутствует,
/// поэтому нельзя делать эту функцию public
/// </summary>
public static PatientPhysioData CutPhysioDataFromLeftToRight(
this PatientPhysioData _this, Marker leftMarker, Marker rightMarker)
{
System.Diagnostics.Debug.Assert(_this != null);
var newPhysioData = new PatientPhysioData();
// Копируем все сигналы из исходных физиологических данных
foreach (ChannelData channel_data in _this.Channels.Values)
{
var channelFragment = _this.CutChannelDataFromLeftToRight(channel_data, leftMarker, rightMarker);
newPhysioData.Channels[channel_data.ChannelId] = channelFragment;
}
// вот на сколько микросекунд все сдвигается влево:
long microseconds = 0;
if (leftMarker != null)
{
microseconds = leftMarker.TimestampUsec;
}
// Модифицируем информацию о метках
foreach (Marker marker in _this.Markers.Values)
{
if (marker.TimestampUsec < microseconds)
{
// пропускаем метки, которые созданы раньше чем left_marker
continue;
}
if (rightMarker != null && rightMarker.TimestampUsec < marker.TimestampUsec)
{
// пропускаем метки, которые созданы позже чем right_marker
continue;
}
// создаем копию метки
Marker newMarker = new Marker(marker);
// добавляем метку
newPhysioData.Markers[newMarker.Id] = newMarker;
// .. и смещаем метку на microseconds влево
newPhysioData.MoveMarker(newMarker.Id, 0 - microseconds);
}
return(newPhysioData);
}
public static ChannelData GetChannelDataFromLeftToRight(
this PatientPhysioData _this,
ChannelData channelData,
long leftMarkerId,
long leftMarkerOffset,
long rightMarkerId,
long rightMarkerOffset)
{
if (null == channelData)
{
return(null);
}
Marker leftMarker = _this.GetMarkerByIdOrDefault(leftMarkerId);
Marker rightMarker = _this.GetMarkerByIdOrDefault(rightMarkerId);
// Вырезать данные и вернуть их.
return(_this.CutChannelDataFromLeftToRight(channelData, leftMarker, rightMarker));
}
/// <summary>
/// Смещает метку на заданное кол-во микросекунд.
/// Максимальное положение метки на оси времени не контролируется.
/// </summary>
/// <param name="markerId">Идентификатор метки</param>
/// <param name="markerOffset">Смещение метки в микросекундах</param>
public static void MoveMarker(
this PatientPhysioData _this, long markerId, long markerOffset)
{
if (!_this.ContainsMarker(markerId))
{
return;
}
var marker = _this.GetMarkerByIdOrDefault(markerId);
// нет смысла двигать маркер, если он установлен на "минус бесконечность"
if (long.MinValue == marker.TimestampUsec)
{
return;
}
// метка не может быть установлена раньше начала записи данных
if ((marker.TimestampUsec + markerOffset) < 0)
{
markerOffset = 0 - marker.TimestampUsec;
}
// модифицировать канальные метки, соответствующие данному маркеру
// максимальное положение метки на оси времени не контролируется
foreach (ChannelMark channelMark in marker.ChannelMarks)
{
var channelData = _this.Channels[channelMark.ChannelId];
System.Diagnostics.Debug.Assert(channelData != null);
double channelMarkerOffset = _this.MoveChannelMarker(channelMark, markerOffset, channelData);
// разница между требуемым смещением метки канала и реально полученным
// может быть меньше нуля только тогда, когда требуемое новое положение метки
// лежит на временной оси раньше начала данных канала.
double markerOffsetDelta = ((double)markerOffset) - channelMarkerOffset;
// дополняем смещение метки канала, невыходящее за границы временного интервала данных,
// смещением до заданного нового положения метки синхронизации.
channelMark.Offset += (long)Math.Floor(markerOffsetDelta);
}
// новое положение метки синхронизации
marker.TimestampUsec += markerOffset;
}
/// <summary>
/// Возвращает фрагмент сигнала из всех каналов нужного типа от маркера left до маркера right.
/// </summary>
/// <param name="physioSignalType">нужный тип физиологического сигнала.</param>
/// <param name="leftMarkerId"></param>
/// <param name="rightMarkerId"></param>
/// <returns></returns>
/// <remarks></remarks>
public static IEnumerable <ChannelData> GetChannelDataBySignalType(
this PatientPhysioData _this,
SignalType physioSignalType,
long leftMarkerId,
long rightMarkerId)
{
// Берем сигналы нужного типа целиком
var channels = _this.GetChannelDataBySignalType(physioSignalType);
// Найти объекты-маркеры, соответствующие left_marker и right_marker
Marker leftMarker = _this.GetMarkerByIdOrDefault(leftMarkerId);
Marker rightMarker = _this.GetMarkerByIdOrDefault(rightMarkerId);
var fragments = channels.Select(
c => _this.CutChannelDataFromLeftToRight(c, leftMarker, rightMarker)
);
return(fragments);
}
/// <summary>
/// Смещает метку канала на заданное кол-во микросекунд.
/// Возвращает смещение в микросекундах,
/// на которое реально была перемещена метка канала.
/// </summary>
/// <param name="marker">Метка канала</param>
/// <param name="offset">Смещение метки в микросекундах</param>
/// <param name="channel">Канал данных</param>
public static double MoveChannelMarker(
this PatientPhysioData _this,
ChannelMark marker,
long offset,
ChannelData channel)
{
// Частота оцифровки канала
double samplingRate = channel.SamplingRate;
// Кол-во данных канала
double dataCount = channel.Data.Length;
// Длина канала в микросекундах
double dataMicroseconds = dataCount / samplingRate * OneM;
// Положение метки во времени относительно начала данных канала в микросекундах
double markerPosition = ((double)marker.Count) / samplingRate * OneM + (double)marker.Offset;
// Новое положение метки на канале в микросекундах
double newMarkerPosition = markerPosition + (double)offset;
if (newMarkerPosition < 0)
{
newMarkerPosition = 0;
}
else if (newMarkerPosition > dataMicroseconds)
{
newMarkerPosition = dataMicroseconds;
}
// Новое кол-во отсчетов метки
marker.Count = (long)Math.Floor(newMarkerPosition * samplingRate / OneM);
// Новое смещение метки в микросекундах
marker.Offset = (long)Math.Floor(newMarkerPosition - ((double)marker.Count) / samplingRate * OneM);
// Новое положение метки на канале с учетом Math.Floor
newMarkerPosition = ((double)marker.Count) / samplingRate * OneM + (double)marker.Offset;
// Смещение в микросекундах, на которое реально была перемещена метка канала
return(newMarkerPosition - markerPosition);
}
/// <summary>
/// Создает метку при пост-обработке данных
/// Метка будет соответствовать количеству данных в каждом из каналов
/// на момент создания данной метки.
/// Метка будет добавлена в массив меток (соответственно,
/// массив меток будет заменен на новый экземпляр).
/// </summary>
/// <returns></returns>
public static Marker CreateMarkerOffline(this PatientPhysioData _this)
{
var channels = _this.Channels;
var channelMarks = new ChannelMark[channels.Count];
long timestampUsec = 0;
int i = 0;
foreach (ChannelData channel in channels.Values)
{
ChannelMark cm = new ChannelMark
{
ChannelId = channel.ChannelId,
// Время, прошедшее с момента получения последней метки времени.
Offset = 0,
// Кол-во данных в буфере канала, соответствующее последней метке времени.
Count = channel.Data.Length
};
channelMarks[i++] = cm;
// Кол-во микросекунд, прошедших с начала записи данных
// (результат фиксируется по последнему каналу).
timestampUsec = (long)(OneM * channel.Data.Length / channel.SamplingRate);
}
// Увеличиваем номер маркера.
++_this.MaxMarkerId;
Marker marker = new Marker
{
Id = _this.MaxMarkerId,
ChannelMarks = channelMarks,
TimestampUsec = timestampUsec
};
_this.Markers[marker.Id] = marker;
return(marker);
}
/// <summary>
/// </summary>
/// <param name="markerId"></param>
/// <returns></returns>
public static Marker GetMarkerByIdOrDefault(this PatientPhysioData _this, long markerId)
{
return(_this.Markers.ContainsKey(markerId) ? _this.Markers[markerId] : null);
}
/// <summary>
/// Возвращает время от начала измерения
/// до создания данного маркера.
/// </summary>
/// <param name="markerId"></param>
/// <returns></returns>
public static TimeSpan GetAbsoluteTimeForMarker(this PatientPhysioData _this, long markerId)
{
Marker marker = _this.GetMarkerByIdOrDefault(markerId);
return(new TimeSpan(marker.TimestampUsec * 10));
}
/// <summary>
/// Возвращает буфер для данных канала.
/// </summary>
/// <param name="channelId">
/// Полное (включая пространство имен) имя канала
/// </param>
/// <returns></returns>
public static ChannelData GetChannelData(this PatientPhysioData _this, string channelId)
{
return(_this.Channels.ContainsKey(channelId) ? _this.Channels[channelId] : null);
}
public static ChannelData GetFirstChannelDataByPhysioSignalTypeName(
this PatientPhysioData _this, SignalType physioSignalType)
{
return(_this.GetChannelDataBySignalType(physioSignalType).FirstOrDefault());
}
/// <summary>
/// Возвращает true если физиологические данные
/// содержат маркер с указанным идентификатором.
/// </summary>
public static bool ContainsMarker(this PatientPhysioData _this, long markerId)
{
return(_this.Markers.ContainsKey(markerId));
}
public static PatientPhysioData GetToRight(this PatientPhysioData _this, long rightMarkerId)
{
return(_this.GetFromLeftToRight(0, rightMarkerId));
}
public static PatientPhysioData GetFromLeft(this PatientPhysioData _this, long leftMarkerId)
{
return(_this.GetFromLeftToRight(leftMarkerId, 0));
}
