protected override void Context()
{
sut = new XmlCacheSerializer <Compound, Unit, TestSerializationContext>();
_cache = new Cache <Compound, Unit>();
var d1 = new Unit {
Name = "mg", Color = Color.WhiteSmoke
};
var p1 = new Compound("1")
{
Name = "toto", CompoundType = "Acid"
};
var d2 = new Unit {
Name = "oo", Color = Color.Wheat
};
var p2 = new Compound("2")
{
Name = "tata", CompoundType = "base"
};
var serializerRepository = new XmlSerializerRepository <TestSerializationContext>();
var attributeMapperRepository = new AttributeMapperRepository <TestSerializationContext>();
attributeMapperRepository.AddDefaultAttributeMappers();
serializerRepository.AddSerializer(new CompoundSerializer().WithRepositories(serializerRepository, attributeMapperRepository));
serializerRepository.AddSerializer(new UnitSerializer().WithRepositories(serializerRepository, attributeMapperRepository));
serializerRepository.AddSerializer(sut.WithRepositories(serializerRepository, attributeMapperRepository));
_cache.Add(p1, d1);
_cache.Add(p2, d2);
serializerRepository.PerformMapping();
_context = new TestSerializationContext();
}
protected override void AddInitialSerializer()
{
base.AddInitialSerializer();
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new SpeciesXmlAttributeMapper());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new GenderXmlAttributeMapper());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new PopulationXmlAttributeMapper());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new ModelConfigurationXmlAttributeMapper());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new ObjectPathXmlAttributeMapper());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new SystemicProcessTypeXmlAttributeMapper());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new ApplicationTypeXmlAttributeMapper());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new ViewLayoutXmlAttributeMapper());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new DistributionTypeXmlAttributeMapper());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new IconSizeAttributeMapper());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new DosingIntervalXmlAttributeMapper());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new LabelGenerationStrategyXmlAttributeMapper());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new DiseaseStateXmlAttributeMapper());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <TransportDirectionId, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <Localization, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <OrganType, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <BuildingBlockStatus, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <ProtocolMode, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <MembraneLocation, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <PivotArea, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <StatisticalAggregationType, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <NotificationType, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <BarType, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <AxisCountMode, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <PopulationAnalysisType, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <InteractionType, SerializationContext>());
//PKSim Serializers
this.AddSerializers(x =>
{
x.Implementing <IPKSimXmlSerializer>();
x.InAssemblyContainingType <PKSimXmlSerializerRepository>();
x.UsingAttributeRepository(AttributeMapperRepository);
});
//SBSuite.Presentation serializer
this.AddPresentationSerializers();
}
private void initialize()
{
var attributeMapperRepository = new AttributeMapperRepository <ParameterIdentificationExportSerializationContext>();
attributeMapperRepository.AddDefaultAttributeMappers();
attributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new LLOQModeXmlAttributeMapper <ParameterIdentificationExportSerializationContext>());
attributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new LLOQUsageXmlAttributeMapper <ParameterIdentificationExportSerializationContext>());
attributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new DimensionExportAttributeMapper());
attributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <Scalings, ParameterIdentificationExportSerializationContext>());
//register all available serializer
this.AddSerializers(x =>
{
x.Implementing <IParameterIdentificationExportSerializer>();
x.InAssemblyContainingType <ParameterIdentificationExportSerializerRepository>();
x.UsingAttributeRepository(attributeMapperRepository);
});
PerformMapping();
}
private void initialize()
{
var attributeMapperRepository = new AttributeMapperRepository <SimModelSerializationContext>();
attributeMapperRepository.AddDefaultAttributeMappers();
//remove double attribute mapper since we need a special implementation in order to export nan, and inf
//properly
attributeMapperRepository.RemoveAttributeMapperFor <double>();
attributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new SimModelDoubleAttributeMapper());
//register all available serializer
this.AddSerializers(x =>
{
x.Implementing <ISimModelSerializer>();
x.InAssemblyContainingType <SimModelSerializerRepository>();
x.UsingAttributeRepository(attributeMapperRepository);
});
PerformMapping();
}
protected override void AddInitialMappers()
{
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new ParameterFlagAttributeMapper());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new DimensionAttributeMapper());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new ParameterBuildModeAttributeMapper());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new PKSimBuildingBlockTypeXmlAttributeMapper());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new OriginXmlAttributeMapper());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new DataColumnAttributeMapper());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new StringEnumerableAttributeMapper());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new TimeSpanAttributeMapper());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <ContainerMode, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <QuantityType, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <TransportType, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <ContainerType, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <PKParameterMode, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <AxisTypes, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <Scalings, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <NumberModes, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <LegendPositions, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <LineStyles, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <Symbols, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <InterpolationModes, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <ReactionDimensionMode, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <ClassificationType, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <FormulaComparison, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <CreationMode, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <ActionType, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <ColumnOrigins, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <AuxiliaryType, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <CriteriaOperator, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new LLOQModeXmlAttributeMapper <SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new LLOQUsageXmlAttributeMapper <SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new ValueOriginSourceXmlAttributeMapper <SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new ValueOriginDeterminationMethodXmlAttributeMapper <SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new RunStatusXmlAttributeMapper());
AttributeMapperRepository.ReferenceMapper = new ObjectReferenceMapper();
}
protected override void Context()
{
sut = new AttributeMapperRepository <TestSerializationContext>();
}
protected override void AddInitialMappers()
{
base.AddInitialMappers();
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <NodeSize, SerializationContext>());
AttributeMapperRepository.AddAttributeMapper(new EnumAttributeMapper <NotificationType, SerializationContext>());
}
