canonicalize() public method

public canonicalize ( ) : bool
return bool
Ejemplo n.º 1
0
 public void test_ASTNode_canonicalizeConstants()
 {
     ASTNode n = new  ASTNode();
       n.setName( "ExponentialE");
       assertEquals( true, n.isName() );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_CONSTANT_E );
       n.setType(libsbml.AST_NAME);
       n.setName( "False");
       assertEquals( true, n.isName() );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_CONSTANT_FALSE );
       n.setType(libsbml.AST_NAME);
       n.setName( "Pi");
       assertEquals( true, n.isName() );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_CONSTANT_PI );
       n.setType(libsbml.AST_NAME);
       n.setName( "True");
       assertEquals( true, n.isName() );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_CONSTANT_TRUE );
       n.setType(libsbml.AST_NAME);
       n.setName( "Foo");
       assertEquals( true, n.isName() );
       n.canonicalize();
       assertEquals( true, n.isName() );
       n = null;
 }
Ejemplo n.º 2
0
 public void test_ASTNode_canonicalizeRelational()
 {
     ASTNode n = new  ASTNode(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "eq");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_RELATIONAL_EQ );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "geq");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_RELATIONAL_GEQ );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "gt");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_RELATIONAL_GT );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "leq");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_RELATIONAL_LEQ );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "lt");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_RELATIONAL_LT );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "neq");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_RELATIONAL_NEQ );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n = null;
 }
Ejemplo n.º 3
0
 public void test_ASTNode_canonicalizeFunctionsL1()
 {
     ASTNode n = new  ASTNode(libsbml.AST_FUNCTION);
       ASTNode c;
       n.setName( "acos");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_ARCCOS );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "asin");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_ARCSIN );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "atan");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_ARCTAN );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "ceil");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_CEILING );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "pow");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_POWER );
       n = null;
       n = new  ASTNode(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "log");
       c = new  ASTNode();
       c.setName( "x");
       n.addChild(c);
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       assertTrue( n.getNumChildren() == 1 );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_LN );
       assertTrue( n.getNumChildren() == 1 );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       c = new  ASTNode();
       c.setName( "y");
       n.addChild(c);
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       assertTrue( n.getNumChildren() == 2 );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_LOG );
       n = null;
       n = new  ASTNode(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "log10");
       c = new  ASTNode();
       c.setName( "x");
       n.addChild(c);
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       assertTrue( n.getNumChildren() == 1 );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_LOG );
       assertTrue( n.getNumChildren() == 2 );
       c = n.getLeftChild();
       assertTrue( c.getType() == libsbml.AST_INTEGER );
       assertTrue( c.getInteger() == 10 );
       c = n.getRightChild();
       assertTrue( c.getType() == libsbml.AST_NAME );
       assertTrue((  "x" == c.getName() ));
       n = null;
       n = new  ASTNode(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "sqr");
       c = new  ASTNode();
       c.setName( "x");
       n.addChild(c);
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       assertTrue( n.getNumChildren() == 1 );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_POWER );
       assertTrue( n.getNumChildren() == 2 );
       c = n.getLeftChild();
       assertTrue( c.getType() == libsbml.AST_NAME );
       assertTrue((  "x" == c.getName() ));
       c = n.getRightChild();
       assertTrue( c.getType() == libsbml.AST_INTEGER );
       assertTrue( c.getInteger() == 2 );
       n = null;
       n = new  ASTNode(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "sqrt");
       c = new  ASTNode();
       c.setName( "x");
       n.addChild(c);
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       assertTrue( n.getNumChildren() == 1 );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_ROOT );
       assertTrue( n.getNumChildren() == 2 );
       c = n.getLeftChild();
       assertTrue( c.getType() == libsbml.AST_INTEGER );
       assertTrue( c.getInteger() == 2 );
       c = n.getRightChild();
       assertTrue( c.getType() == libsbml.AST_NAME );
       assertTrue((  "x" == c.getName() ));
       n = null;
 }
Ejemplo n.º 4
0
 public void test_ASTNode_canonicalizeLogical()
 {
     ASTNode n = new  ASTNode(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "and");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_LOGICAL_AND );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "not");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_LOGICAL_NOT );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "or");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_LOGICAL_OR );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "xor");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_LOGICAL_XOR );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n = null;
 }
Ejemplo n.º 5
0
 public void test_ASTNode_canonicalizeFunctions()
 {
     ASTNode n = new  ASTNode(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "abs");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_ABS );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "arccos");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_ARCCOS );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "arccosh");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_ARCCOSH );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "arccot");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_ARCCOT );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "arccoth");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_ARCCOTH );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "arccsc");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_ARCCSC );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "arccsch");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_ARCCSCH );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "arcsec");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_ARCSEC );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "arcsech");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_ARCSECH );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "arcsin");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_ARCSIN );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "arcsinh");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_ARCSINH );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "arctan");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_ARCTAN );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "arctanh");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_ARCTANH );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "ceiling");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_CEILING );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "cos");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_COS );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "cosh");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_COSH );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "cot");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_COT );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "coth");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_COTH );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "csc");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_CSC );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "csch");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_CSCH );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "exp");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_EXP );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "factorial");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_FACTORIAL );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "floor");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_FLOOR );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "lambda");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_LAMBDA );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "ln");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_LN );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "log");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_LOG );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "piecewise");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_PIECEWISE );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "power");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_POWER );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "root");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_ROOT );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "sec");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_SEC );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "sech");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_SECH );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "sin");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_SIN );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "sinh");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_SINH );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "tan");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_TAN );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "tanh");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION_TANH );
       n.setType(libsbml.AST_FUNCTION);
       n.setName( "Foo");
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n.canonicalize();
       assertTrue( n.getType() == libsbml.AST_FUNCTION );
       n = null;
 }