Ejemplos de CQS.Genome.Pileup SomaticMutationPileupBuilderOptions en C# (CSharp)

Ejemplo n.º 1

Archivo: TestSomaticMutationPileupBuilder.cs Proyecto: shengqh/CQS.Test

    public void Test()
    {
      SomaticMutationPileupBuilderOptions options = new SomaticMutationPileupBuilderOptions ();
      options.NormalFile = "../../../data/small.bam";
      options.TumorFile = "../../../data/small.bam";

      SomaticMutationPileupBuilder pib = new SomaticMutationPileupBuilder(options);

      //Assert.IsNotNull(pib.Chromosomes);

      //Assert.AreEqual(66, pib.Chromosomes.Count);
      //Assert.AreEqual("chr1", pib.Chromosomes.First());
      //Assert.AreEqual("chrY_JH584303_random", pib.Chromosomes.Last());
    }

Ejemplo n.º 2

 public SomaticMutationPileupBuilder(SomaticMutationPileupBuilderOptions options)
 {
     this.options = options;
 }

Ejemplo n.º 3

Archivo: SomaticMutationPileupBuilder.cs Proyecto: shengqh/CQS.Core

 public SomaticMutationPileupBuilder(SomaticMutationPileupBuilderOptions options)
 {
   this.options = options;
 }