public bool Compare(Phrase compare, out int exactMatch, out int partialMatch)
{
bool result = false;
CCount matchCount = new CCount();
char[] outer = this.CharValue();
char[] inner = compare.CharValue();
// this outer
for (int i = 0; i < PhraseSize; i++)
{
// compare inner
for (int j = 0; j < PhraseSize; j++)
{
//exact match
if (outer[i] == inner[j] && i == j)
{
switch (outer[i])
{
case 'G':
matchCount.G++;
break;
case 'A':
matchCount.A++;
break;
case 'T':
matchCount.T++;
break;
case 'C':
matchCount.C++;
break;
}
}
}
}
exactMatch = matchCount.G + matchCount.A + matchCount.T + matchCount.C;
// (if actual > 0 ? ((if guess >= actual ? actual : guess) - matchcount) : 0) + ...
partialMatch = (this.Count.G > 0 ? (compare.Count.G >= this.Count.G ? this.Count.G : compare.Count.G) - matchCount.G : 0) +
(this.Count.A > 0 ? (compare.Count.A >= this.Count.A ? this.Count.A : compare.Count.A) - matchCount.A : 0) +
(this.Count.T > 0 ? (compare.Count.T >= this.Count.G ? this.Count.T : compare.Count.T) - matchCount.T : 0) +
(this.Count.C > 0 ? (compare.Count.C >= this.Count.C ? this.Count.C : compare.Count.C) - matchCount.C : 0);
if (exactMatch == PhraseSize)
{
result = true;
}
return(result);
}
public bool Compare(Phrase compare, out int exactMatch, out int partialMatch)
{
bool result = false;
CCount matchCount = new CCount();
char[] outer = this.CharValue();
char[] inner = compare.CharValue();
// this outer
for (int i = 0; i < PhraseSize; i++)
{
// compare inner
for (int j = 0; j < PhraseSize; j++)
{
//exact match
if (outer[i] == inner[j] && i == j)
{
switch (outer[i])
{
case 'G':
matchCount.G++;
break;
case 'A':
matchCount.A++;
break;
case 'T':
matchCount.T++;
break;
case 'C':
matchCount.C++;
break;
}
}
}
}
exactMatch = matchCount.G + matchCount.A + matchCount.T + matchCount.C;
// (if actual > 0 ? ((if guess >= actual ? actual : guess) - matchcount) : 0) + ...
partialMatch = (this.Count.G > 0 ? (compare.Count.G >= this.Count.G ? this.Count.G : compare.Count.G) - matchCount.G : 0) +
(this.Count.A > 0 ? (compare.Count.A >= this.Count.A ? this.Count.A : compare.Count.A) - matchCount.A : 0) +
(this.Count.T > 0 ? (compare.Count.T >= this.Count.G ? this.Count.T : compare.Count.T) - matchCount.T : 0) +
(this.Count.C > 0 ? (compare.Count.C >= this.Count.C ? this.Count.C : compare.Count.C) - matchCount.C : 0);
if (exactMatch == PhraseSize)
{
result = true;
}
return result;
}
