コード例 #1
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ファイル: Convertor.cs プロジェクト: harisreedhar/NCDK
        public CMLCml CDKReactionSchemeToCMLReactionSchemeAndMoleculeList(IReactionScheme cdkScheme)
        {
            var cml = new CMLCml();

            cml.Add(CDKAtomContainerSetToCMLList(ReactionSchemeManipulator.GetAllAtomContainers(cdkScheme)));
            cml.Add(CDKReactionSchemeToCMLReactionScheme(cdkScheme, true));
            return(cml);
        }
コード例 #2
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ファイル: Convertor.cs プロジェクト: harisreedhar/NCDK
        private CMLCml CDKChemFileToCMLList(IChemFile file, bool setIDs)
        {
            var cmlList = new CMLCml {
                Convention = "cdk:document"
            };

            if (useCMLIDs && setIDs)
            {
                IDCreator.CreateIDs(file);
            }
            if (!string.IsNullOrEmpty(file.Id))
            {
                cmlList.Id = file.Id;
            }

            foreach (var sequence in file)
            {
                cmlList.Add(CDKChemSequenceToCMLList(sequence));
            }

            return(cmlList);
        }